提取原料不同深海魚油一般是提取自深海魚(生活在百米以下深海區域的海魚)的脂肪提取物一，般是主要是肌肉部分 。
【深海魚油和魚肝油的區別】 魚肝油是直接從鯊魚、鱈魚等海魚肝臟中提煉出來的脂肪，其性狀為黃色至橙紅色的澄清液體，有特異的魚腥臭 。
成份不同深海魚油是深海魚體內全部油脂類物質的總稱，其主要成分是ω-3不飽和脂肪酸，包括二十二碳六烯酸(簡稱DHA)和二十碳五烯酸(簡稱EPA)，有調節血脂、預防心腦血管疾病，促進幼兒大腦和視網膜神經發育等功效 。
魚肝油主要成分是維生素A和維生素D，可以防止由于維生素A缺乏引起的夜盲癥，同時有助于鈣的吸收和促進骨骼鈣化的功能，Omega-3脂肪酸幾乎沒有 。
魚肝油常用于防治夜盲癥、角膜軟化、佝僂病和骨軟化癥等，對呼吸道上層粘膜等表皮組織也有保護作用 。它主要由不飽和度較高的脂肪酸甘油脂組成，此外還有少量的磷脂和不皂化物，對人體有很大的好處 。
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