先用55-60℃的溫水對黑籽南瓜進行溫湯浸種，再浸泡6-8小時，然后用清水反復沖洗，去除種子表面的黏液，瀝干水分后用濕布包好，置于25-28℃條件下催芽，當大部分種子露白后播種，播種后覆膜保濕 。可直接播于營養缽（袋）中，也可播于事先準備好的苗床中 。
播種后保持苗床溫度25-28℃，一般4-5天后即可出苗 。出苗后，白天要揭去覆蓋的地膜，苗床白天溫度不超過25℃，夜間維持在15-16℃ 。也可以采用分苗的方式育苗，即先播種在苗床上，密度較大，待出苗后5-7天，兩片子葉完全展開時再移栽到營養缽（袋）中，待移栽成活后，夜溫由15℃降到10℃左右 。苗床要注意通風降濕，防止幼苗徒長 。當幼苗長到4或5片真葉，側枝剛萌生時，即可定植 。一般育苗期40天左右 。
【栽培黑籽南瓜怎樣進行育苗 黑籽南瓜種子浸種處理】種植黑籽南瓜，應在早春及早播種，如播種過晚，氣溫日漸升高、日照時間逐漸延長，會導致雌花生長不良，不易結瓜 。
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