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慢性炎癥身體存在長期的慢性炎癥是引起肛門直腸炎的原因之一，例如慢性細菌感染、慢性非特異性結腸炎等，使得粘膜發生肉芽腫、炎性變和假息肉階段而發生炎變 。此外，痔瘡、肛瘺、肛裂、毛囊炎等長期刺激肛門皮膚 ， 也可引起炎變 。
慢性炎癥的感染患有結腸炎的患者大部分與慢性炎癥的感染有關 。如長期受到慢性細菌感染，阿米巴痢疾，慢性非特異性結腸炎，等慢性疾病的刺激使得粘膜發炎病變，假息肉等一些癥狀發生炎癥感染所致 。
異物損傷還有由于異物損傷所引起的直腸炎，這種病因比較常見 ， 因為直腸受到如硬東西 ， 骨片，未消化的木片，和其他一些堅硬的食物碎渣，帶有棱角的食物等都會刺激損傷粘膜，而引起直腸炎 。還有的是大便干結時 ， 由于拉出的大便很硬就會使粘膜受到損傷而導致直腸炎 。
性病也會導致直腸炎【直腸炎是怎樣形成的 直腸炎的危害】由于不潔的肛交，使肛門處感染上尖銳濕疣或者其他的纖維瘤等，就會引起病變 ， 炎癥，受到強烈的刺激摩擦 ， 發生感染就會導致直腸炎的發生 。還有一些原因是遺傳基因的因素造成的，還有很多其他的病因如長期受到痔瘡，肛瘺，肛裂，或者良性腫瘤的惡變等等原因 。
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