赤蘚糖醇的副作用大量的動物和臨床實驗已經證明赤蘚糖醇安全無毒，無致畸毒性，不會引起染色體變 異，也不會影響生殖和發育，不致癌變，也不刺激腫瘤生長，消化道對其有較好的耐受性，對糠尿病患者的代謝沒有明顯的影響,對血糖控制無副作用 。
不過有一項研究顯示，一種可以感染人畜的病原菌布魯桿菌可以代謝赤蘚糖醇，但沒有證據顯示布魯桿菌是腸道的“常住民”，所以暫時不用擔心赤蘚糖醇會影響腸道菌群的平衡 。
雖然赤蘚糖醇無毒，但是一般來說患腸易激綜合征或其他消化疾病的人最好要避免使用包含赤蘚糖醇的產品 。此類病人食用赤蘚糖醇可能會加重病癥 。
2、不會影響正常的醣類代謝，不會造成血糖明顯上升，并不影響胰島素分泌，適合用來替代蔗糖用于糖尿病患者的食物或飲料中，缺點是幾乎不會產生熱量，無法在低血糖時以此進行急救 。【赤蘚糖醇的副作用】
3、在目前已知的糖醇中，熱量值最低 。
4、赤蘚糖醇會抑制容易引起蛀牙的轉糖鏈球菌(Streptococcus mutans)生長，不易生成牙菌斑，不過受限于成本，目前應用的產品較少 。
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赤蘚糖醇的每日攝取量國外研究指出，赤蘚糖醇每天容許量約50公克，單次服用大于50公克會出現噁心與胃部不適感，不同人對于赤蘚糖醇的耐受度會有差異 。
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