臺灣通行證證件有效期為五年，簽注的有效期因簽注類型不同而不同 ， 介紹如下：
L簽注：發給赴臺團隊旅游人員，簽發3個月一次有效簽注;旅行社領隊簽發一年內多次有效簽注 。
G簽注：發給赴臺個人旅游人員，簽發6個月一次有效簽注（本市不簽發“G”簽） 。
D簽注：發給赴臺定居、返臺事由的人員，簽發6個月一次有效簽注 。
J簽注：發給赴臺居留、返鄉、依親的人員，簽發三年多次有效簽注 。
T簽注：發給赴臺探親、團聚、探病的人員，可簽發6個月一次有效簽注或1年、2年、3年多次有效簽注 。
X簽注：發給赴臺就學人員，簽發相應期限的多次有效簽注 。
Q簽注：發給赴臺訪友、接受和處理財產、處理婚喪事宜、訴訟等私人事務，以及就醫或陪護的人員，簽發6個月一次有效簽注 。
Y簽注：發給赴臺進行經濟、文化、科技、體育、學術等交流活動或者參加會議等人員 。可簽發6個月一次有效簽注或1年、2年、3年多次有效簽注 。
F簽注：發給赴臺進行經貿、交流活動的人員 。可簽發6個月一次有效簽注或1年、2年、3年多次有效簽注 。
C簽注：發給執行兩岸直航航運任務的乘務人員，簽發1年多次有效簽注 。
注：在臺灣的停留時間 ， 自入境之日起不超過15天，并必須在規定時間內返回大陸 。
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