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矮化自根砧苗木的優勢有：整齊度、高早果豐產、須根多，根系發達等等 。矮化自根砧苗木的整齊度高，蘋果矮化自根砧苗木的砧木利用無性繁殖，因而有株間的遺傳差異小、苗木的一致性高、建園整齊度高、果個均勻一致的特征 。而矮化中間砧苗木在基砧為實生砧時，果園的整齊度較差 ， 且同一型號矮化砧的矮化效應和一致性的表現比其作為自根砧時要差一些 。
【什么是自根砧蘋果苗 自根砧蘋果苗的優勢】
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矮化自根砧苗木早果豐產 ， 蘋果矮化自根砧苗木與矮化中間砧和短枝形苗木相比除在早果豐產上有相似之處外，突出的表現是主干生長勢強，產量高 ， 著色好，糖度高，果個均勻 。據生產實踐中調查顯示，蘋果矮化自根砧苗木主干生長勢強，特別適合于紡錘形整形；果園容易管理，可獲得較高的經濟效益 。當然，蘋果矮化自根砧苗木密植栽培所獲得的優質高產穩產與其需要較高的肥水條件關系很大 。
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須根多，根系發達，用作自根苗砧木的種質，其莖段或根系屬莖源根或分蘗根 ， 再生能力較強，沒有明顯的主根，須根發達 。據調查，一年生圓葉海棠扦插苗，每株平均20厘米以上的須根達12個，M26、M7壓條分株苗分別為11個、9個，根系是同齡實生砧苗的2倍 。
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