(1)選用抗病品種
根據各地生產情況選用不同的抗病品種 。
（2）選用無病種子或種子消毒處理
55℃溫水浸種15分鐘后冷卻，或用40%福爾馬林150倍液浸種30分鐘后用清水沖洗干凈，再放入冷水中浸5小時 。西瓜品種間對福爾馬林敏感程度各異，應先試驗，避免產生藥害 。【如何防治瓜類炭疽病？ 南瓜炭疽病如何防治】
(3)輪作
與非瓜類作物實行3年以上輪作 。
（4）加強管理
選擇沙質土，注意平整土地，采用合理施肥；施用腐熟的堆肥，防止積水，雨后及時排水，合理密植，及時清除田間雜草 。
(5)藥劑防治
保護地和露地在發病初期以50%甲基硫菌靈可濕性粉劑800倍液加75%百菌清可濕性粉劑800倍液，或50%多菌靈可濕性粉劑800倍液加75%百菌清可濕性粉劑800倍液混合噴霧 。保護地栽培的，可采用煙霧法或粉塵法，5%百菌清粉塵劑或施用10%速克靈煙劑，隔9天1次，連續防治3-4次 。
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