栽培種培養基的制作過程同原種的制備 。但由于栽培種數量大，目前生產上除了采用同原種相同的菌種瓶外，普遍采用塑料袋作為容器制備栽培種 。
常用的塑料袋規格為14-15厘米x33厘米x0.05厘米和14-15厘米x45厘米x0.05厘米的高壓聚丙烯塑料袋或者低壓聚乙烯塑料袋 。規格14-15厘米x33厘米x0.05厘米的塑料袋，一端開口，一頭接種，每袋裝干料250克左右；規格14-15厘米×45厘米x0.05厘米的塑料袋，兩端開口，兩頭接種，每袋裝干料500克左右 。【食用菌栽培種培養基的制作 食用菌栽培種培養基的制備】
瓶裝菌種培養基的制作方法同原種的制作 。
如果以塑料袋作為容器，可以手工裝料，量大時可利用裝瓶、裝袋兩用機 。裝料要求松緊適度，上下均勻一致．袋壁光滑，料面平整 。綁口時袋口可套塑料環 ， 塞棉塞；也可直接綁繩 。
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